妈祖第1集剧情
东海龙王次子睚眦，凶残好斗、野心勃勃、报复心强，他与其爪牙常在海面兴风作浪，伤及生灵。赤脚大仙发现，奏明玉帝，在王母娘娘的支持下，准许他在凡间物色、培育一位统辖海上救援诸事的海神苗子。岛上渔民林愿夫人去观音庙求子，得观音赐孕，十四月迟迟不生，睚眦唆使部下变化成道人造谣，以至于蒙蔽村民，险些驱逐林家离岛。婴儿出生后，沉默不语，取名默娘，默娘有慧根与善心，观音菩萨与赤脚大仙暗地收她为徒。
妈祖第2集剧情
少年默娘得到赤脚大仙的点化帮助，渐渐有了悟性和法力，大仙又传她医书，吸引她苦读，使她拥有了超常的医术。睚眦妄图称霸东海，偷炼乾坤大法，结果不但闹得东海仿佛地震，他自己也昏迷过去，现出怪鱼的原形，被渔民胡子贵捕获。胡是个好利的人，想把怪鱼拿到集市上卖掉，却被善良的默娘发现而苦求哥哥给予放生。默娘哥哥林洪毅禁不住小妹的哀求，不惜偷走妻子李月莲的陪嫁赎回那条怪鱼，兄妹将其放生。菩萨和大仙通过对默娘的考察，非常满意，又传授她银镯等法宝。睚眦被网后碰掉鱼鳞，落下了奇痒症，他记不得默娘救过他，反而加剧报复渔民，派部下晏公制造海难，林愿为了渔民的生存，不得不去莆田求知县江施旗请玄通道长设坛捉妖。
妈祖第3集剧情
玄通道长将晏公收入宝瓶，却被晏公逃脱，玄通颜面扫尽，晏公也因此瘸了一条腿。默娘偶然在古井遇到大仙，获得了铜镜，在揣摩宝镜玄妙中，默娘长大成人，她身具灵异，能观天象，预知阴晴，屡次帮助渔民避免了海灾的伤害，因此，极受村民们信任、推崇。默娘在菩萨和大仙的帮助下，有了预见海上灾难的能力，并可在昏睡状态下灵魂出窍，飞跃救人。海妖两次制造海难，默娘预感到胡子贵儿子受伤前去报信，反而遭受了胡家的辱骂，结果，胡家儿子果然被抬回。在事实面前，胡子贵心服口服，称默娘为仙姑。
妈祖第4集剧情
睚眦在母亲珍妃和妻子蚌妃的怂恿下野心渐炽。他见龙王精力不足，甚至想取代龙王管理东海的事务。但龙王并不想逊位，睚眦急切中越发疯狂，四龙子狴犴德才兼备，是他最有力的对手与障碍，手下又有东海最高手龟将军辅佐，因此，睚眦等千方百计欲先灭掉龟将军，而后再除掉狴犴。默娘观天象见附近海面当日无风，鼓励渔民出海，没想到恰遇上睚眦一伙与龟将军对决，引起风浪，众渔船落难。默娘于梦中飞去海面救难时，母亲王氏见她昏睡以为偷懒，将其摇醒，救人的默娘眼见得离遇险人越飞越远。
妈祖第5集剧情
意外的海难，不但胡子贵家两个儿子被淹死，还夺去了默娘最亲爱的哥哥洪毅的性命。胡子贵丧子痛极，把罪过归到默娘头上，善良的林愿忍着失去独生子的悲痛，反而代女儿向胡家赔礼。胡家的行为被默娘儿时的伙伴杨生全所不齿。默娘从哥哥的教训中总结出海岛不能没有医生，她向父亲借钱购买药材，立志为乡亲们治病。林愿虽然不信任女儿有那么大的本事，但他还是支持了默娘，并亲身给女儿做试验品。邻岛遭遇了瘟疫，渔女桂花一家惨死，桂花也奄奄一息。胡子贵等村民为了自保，要把桂花活焚。王氏在关键时挺身而出，保护了桂花。默娘决定去魔岛从海妖手中索取圣泉水，驱除瘟疫，救活染病乡亲。
妈祖第6集剧情
默娘刚到魔岛，就被海妖嘉应、嘉佑用法术捉住。但她临危不惧，靠智慧逃出魔窟，并成功取到了圣泉水。海岛渔村这边，愚昧的乡邻们正逼着桂花自焚，默娘如从天降，滴圣泉水救活桂花，然而，她的母亲王氏终因染上瘟疫，没有等到女儿来施救。默娘也因为劳累而昏睡过去……桂花成了林家的一员，她忠心耿耿地跟着默娘到周围各岛分发圣水，瘟疫终于彻底消除。然而，事情并未完结，睚眦的奇痒症经常复发，他越发迁怒于渔民，于是，变本加厉地指使他手下的海妖们去海面上杀伤渔民，为他复仇。
